Desa Pakis terdiri dari sembilan dusun administratif yang tersebar di wilayah Kecamatan Bringin. Pusat pelayanan administrasi dan balai pertemuan desa berada di Dusun Gemok.
Wilayah 9 Dusun Desa Pakis
Dusun 01
Dusun Pakis (Krajan)
Pusat permukiman bersejarah dan salah satu simpul aktivitas kelembagaan kemasyarakatan Desa Pakis.
Dusun 02
Dusun Dukuhsari
Kawasan pedusunan yang asri dengan aktivitas pertanian pangan, sayur-mayur, dan perkebunan produktif.
Dusun 03
Dusun Doplang 1
Wilayah pemukiman warga dengan kebersamaan sosial, tradisi keagamaan, dan majelis taklim yang aktif.
Dusun 04
Dusun Doplang 2
Wilayah persawahan subur dan sentra peternakan rakyat sapi potong dan kambing yang dikelola warga.
Dusun 05
Dusun Wates
Kawasan perbukitan yang memiliki panorama bentang alam pegunungan yang sejuk dan jalan aspal tertata.
Dusun 06
Dusun Brojojito
Pemukiman warga dengan kerukunan tetangga yang erat dan tradisi gotong royong yang lestari.
Dusun 07
Dusun Gemah
Wilayah agraris dengan jaringan irigasi persawahan tradisional dan keasrian alam pedesaan Jawa Tengah.
Dusun 08
Dusun Gunungmerak
Dusun berkontur perbukitan dengan kebun buah, pohon tegakan, dan panorama alam nan sejuk.
Dusun 09
Dusun Krumpul
Wilayah pedusunan dengan potensi tanaman palawija, perkebunan rakyat, dan kekayaan tradisi.
